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肥胖ftp(肥胖FTO)

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晨读丨10月15日,关注健康每一天

【新冠病毒】

强生新冠疫苗3期临床试验暂停

强生公司研发的新冠疫苗JNJ-78436735由于参与者出现不明原因疾病而暂停。

强生公司并没有说明这种“不明原因的症状”具体是什么,而是表示“我们必须尊重该参与者的隐私。我们也在进一步了解该参与者的病情,在我们分享更多信息之前掌握所有事实,是很重要的。”此外,强生公司在声明中称,内部临床和安全医生等多方正在审查和评估参与者的健康状况。严重不良反应在临床试验中并不少见,在涉及大量参与者的试验中,严重不良反应事件的数量,预计可能在一定程度上增加。

【医学探索】

脂肪肝易诱发多种心脏代谢疾病

《英国医学杂志》一项研究发现:青少年肥胖和心脏代谢功能障碍有关,与腹部脂肪相比,肝脂肪更易诱发糖尿病、高血脂和高血压等心脏代谢疾病。

研究人员对耶鲁283名儿童和青少年的肝脏脂肪、腹部脂肪和皮下脂肪进行分析发现,与其他因素相比,肝脂肪与心脏代谢功能障碍的关联更为密切,同时对胰岛素会更加不敏感。这意味着,与健康人相比,有脂肪肝的人更容易患一些高血脂、高血压和动脉粥样硬化等心脏代谢类疾病,也会更容易发生胰岛素抵抗(IR) 。

【新药进展】

海思科肺部纤维化创新药获受理

海思科全资子公司四川海思科收到国家药品监督管理局下发的关于创新药FTP-198片的《受理通知书》。FTP-198系海思科研发的化学药品1类创新药,拟用于治疗特发性肺纤维化(IPF)。

IPF是一种病因不明的慢性、进行性纤维化肺部疾病,可引起周围肺纤维化重塑,导致呼吸衰竭。迄今为止,IPF尚无肯定显著有效的治疗药物。海思科称,该药靶点作用机制明确,有可扩展适应症的潜力,除纤维化外,有可能拓展肿瘤、血管生成、自身免疫性疾病、炎症、NASH、神经退行性病变等适应症。

【健康提醒】

去除灰指甲要靠抗真菌药物治疗

不少人认为,拔甲可以对灰指甲进行根治。对此,专家表示,灰指甲学名叫做甲癣,拔甲不是治疗甲癣的首选方法,也不能根除甲癣,新甲长出后仍然可能再次感染真菌,不当拔甲还容易造成甲板变形。只有在极少见的药物治疗无效时,才进行拔甲处理,而且拔甲后还是需要使用抗真菌药物。

据介绍,甲癣的治疗方式主要是抗真菌药物治疗,需要依据病情轻重来选择具体治疗方案。单独的外用药治疗适用于表浅和未累及甲根的损害,大部分轻症患者可以通过坚持外用药物治好。

【知识更新】

肥胖通过肠菌代谢影响记忆功能

《细胞代谢》杂志上的一项研究显示,肠道微生物的芳香族氨基酸代谢物与大脑的记忆功能有关,肥胖可通过这一机制损害记忆功能。

研究者对116名参与者进行测试发现,肥胖者的学习能力、即时回忆、短期延迟回忆和工作记忆能力都有显著的损伤,并在参与者血浆和粪便中找到与记忆功能具体相关的物质,即色氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸三种芳香环氨基酸及其代谢产物。研究者将参与者的肠菌移植给小鼠后发现,移植了高得分者肠菌的小鼠在相关的行为测试中得分更高。

新京报记者 张兆慧

校对 薛京宁

为什么我的耐力分区和功率分区对应不上?

这是一个有一定耐力基础的肥胖车手的室内SST训练,先看心率的分区图

这是一张SST训练的心率分区图

然后看一下功率的分布

这是同一个SST训练的功率分布图

很显然,功率的分区分布和心率的分区分布差异非常的大,以至于让人怀疑是不是FTP测错了导致

新手,尤其是大体重少运动想通过骑车减肥的人很容易碰到这个困惑,老手也会,但是很多时候能够多少明白过来为什么,但是大多不全。

在自行车功率训练中,发现功率区间主要在耐力区(通常对应于低至中等强度的训练区域,如2区),但心率却飙升到接近或达到VO2MAX区(最大摄氧量区域),可能有以下几个原因:

其实一共有七种可能的原因:

1. 有氧基础不足

如果车手的有氧耐力基础不足,即使在相对较低的功率输出下,身体也可能无法有效地供应足够的氧气来满足需求,导致心率升高以尝试补充氧气供应。

2. 训练强度突然增加

在训练中,如果车手突然增加功率输出,即使这个功率输出在技术上属于耐力区,但由于强度增加过快,身体可能需要一段时间来适应新的功率水平,这期间心率可能会暂时升高。

这个主要是训练设计不合理导致的,就不细说了。

3. 环境因素:

高温、高湿或其他不利的环境条件会增加身体的热量负担,导致心率升高,即使功率输出并不高。

这里要特别强调一下高湿度,随着地球变暖400毫米降水线北移,北方的车友很多时候意识不到这个,反而南方的车友对此深有感受。

所以你在室内训练的时候最好有一个温湿度计。

4. 个人生理差异

不同人的心率响应可能有所不同。有些人心率就是高,这与个体的心脏功能、血液流动性、体温调节等因素有关。

但是如果你体检报告表明血脂高,不用想,这种情况几乎必然存在。

5. 脱水或补剂不足

脱水或补剂不足会影响身体的正常功能,导致心率在运动中异常升高。

补剂不足指的是在比赛或者长时训练的时候没有配套的补剂使用计划,这个也是以后再说。

6. 训练恢复不足

说白了就是过度训练,非常常见,身体处于疲劳状态,导致即使在较低强度的训练中,心率也会明显偏高,低区训练还能应付过去,高区很快就撞墙,如果日常不吃抗氧化剂,运气好了还能收获一个感冒。

7. 心理因素

比赛或训练中的心理紧张、焦虑、烦躁或过度兴奋也可能导致心率升高。

毕竟很多时候情绪上的事情不一定是跟骑车有关,过去高速发展阶段还好,往后这些年乃百年未有之大变局,估计要常见了。

要保持平常心。

让我们再次回到训练上来

那么问题来了,如果是新手或者减肥者,是应该以功率为准设计训练还是以心率为准设计呢?

答案是心率,而且最适合的是MAF训练。

MAF训练锚定的是有氧耐力,属于典型的慢就是快的训练思想。

文献解读| 不可思议~人体肠道竟隐藏着十几万的病毒!

原文标题:Massive expansion of human gut bacteriophage diversity

发表期刊:《Cell》

影响因子:41.582

第一作者:Luis F. Camarillo-Guerrero

通讯作者:Trevor D. Lawley

第一单位:英国桑格研究所与欧洲生物信息研究所

文章亮点

1. 数据库包含28,060宏基因组中的142,809个非冗余肠道噬菌体基因组;

2. 宿主分配揭示了噬菌体多样性和宿主范围跨肠道细菌分离物;

3. 流行病学分析揭示了全球分布的280个病毒群;

4. Gubaphage是一种分支,可以感染拟杆菌目的几个成员。

1研究背景

病毒是地球上数量最多的生物实体,估计有10^31个颗粒。噬菌体作为水平基因转移的载体,深刻地影响微生物群落,编码对宿主细菌有益的辅助功能,并促进动态的共同进化互动。几十年来,噬菌体的发现进展缓慢。然而,随着高通量宏基因组学的出现,它有可能发现一个空前数量的新噬菌体多样性。人体肠道内寄生着大量的细菌,这些肠道菌群的失衡,影响着人类肥胖、肠炎、自身免疫疾病、对癌症治疗药物的反应,甚至影响人类寿命等等。因此,了解人类的肠道细菌以及感染这些细菌的噬菌体在人类健康和疾病中的作用是很有必要的。

2研究思路

通过挖掘全球分布的 28,060 个人类肠道宏基因组和 2,898 个培养肠道细菌的参考基因组数据集获得数据。为了识别人类肠道宏基因组中的病毒序列,筛选了超过4500万个组装的contigs ,使用人类肠道噬菌体数据库(GPD)来洞察人类肠道噬菌体的生物学、宿主范围和全球流行病学。

3研究结果
为了进一步提高数据集的质量,研究人员设计了一种机器学习方法来过滤掉污染的可移动基因元件(MGEs)。从IV型分泌系统(细菌4-型分泌系统)中鉴定了携带机械的预测物,表明受共轭移动元素的污染,如质粒或整合和共轭元素(ICEs)。该分类器用噬菌体和ICEs的实验序列进行训练,在人肠道MEGs的独立测试集中表现出良好的性能。GPD中存储的所有基因组的中位基因组完整性估计为63.5%。CheckV对非病毒DNA的估计显示:73.5%的GPD预测没有污染,而84.13%的预测污染<10%。与其他人类肠道噬菌体数据库进行比较,GPD的中位基因组大小最大的为31 kb,其次是IMG/VR和GVD,分别为15 kb和11 kb。

接着利用以95%的平均核苷酸标识(ANI)阈值对最后一组过滤序列进行去复制,获得一个数据库142,809个肠道噬菌体序列。用CheckV估计每个病毒基因组的完整性水平,总共有13429(9.4%)的病毒基因组被归类为完整,27,999(19.6%)为高质量,101,381(70.99%)为基因组片段(<90%完整)。

另外,在与其他公共数库比较时发现,仅由GPD和IMG/VR基因组组成的病毒群分析显示有3699个重叠,而仅由GPD和GVD基因组组成的病毒群则有3,206个;此外,GPD拥有最多的病毒群数量12,731个,另一方面,1,099个病毒群和113个病毒群是IMG/VR和GVD独有的,而3个数据库共享的病毒群有1205个。

在所有门的细菌属水平上分析表明:Lachnospira, Roseburia, Agathobacter, PrevotellaBlautia_A包含的病毒群数量最多,除了普雷沃菌属属于革兰氏阴性普雷沃菌科外,这些属都属于革兰氏阳性的厚壁菌门毛螺菌科家族,与产生丁酸的孢子菌相关。相比之下,每个分离株的病毒多样性最低的是HelicobacterLactobacillus HEnterococcus DPediococcus,由此可见噬菌体丰度在人类肠道细菌中的广泛分布,甚至在同一门内。另外,肠道噬菌体的细菌宿主范围揭示了系统发育上不同的细菌种群之间的大规模连接促进了细菌的适应和进化。

研究人员分析了4种(Firmicutes,Bacteroidetes, Proteobacteria, Actinobacteriota)比较常见的人类肠道细菌门是否存在噬菌体感染的情况。在门水平上,检测到放线菌门中噬菌体感染率显著降低,58.79%的感染菌株,而其他门中至少70%的感染菌株。然后测量了病毒多样性,这一分析表明厚壁菌门具有明显较高的病毒多样性,平均每个分离株有3.13个病毒群,同时也包含了所有门中分配的总病毒群的60%。细菌间基因的水平转移是细菌群落中基因流动的主要驱动因素,不同细菌分类等级的宿主分配表明,大多数病毒群限于感染单一物种(64.51%)。一般来说,每个细菌属的病毒多样性越高,宿主范围广的噬菌体数量就越多。

另外,研究人员还选择了来自6个主要大洲的28个不同国家的数据生成GPD的宏基因组数据集。通过PCA分析,观察到北美、欧洲和亚洲噬菌体与非洲和南美样本的明显分离,同时发现,普氏杆菌在农村/传统的生活方式个体中更丰富,而拟杆菌则是在城市/西方生活方式的个体中居多。而造成这些差异要归因于人类的生活方式,不同的生活方式导致不同人群肠道噬菌体不同。

一个明显的例子是肠道噬菌体的 crAss-like家族,它可以分为10个噬菌体属,其中VIII和IX属是在Malawian样本中最常见的crAss-like噬菌体。通过使用CRISPR精确匹配,预测这两个噬菌体属最可能的宿主是普雷沃特拉菌。根据Malawian样本的结果,还发现在非洲、南美和斐济,VI属、VIII属和IX属的患病率高于属I。因此,crAss-like家族在全球范围内分布,在属水平上具有明显的全球分布格局,这似乎也是受到人类生活方式和肠道类型的强烈影响。全球分布的病毒群的宿主细菌-噬菌体网络图显示:Prevotella是最受关注的属,其次是FaecalibacteriumRoseburia。

在计算每个病毒群的基因组数量时,发现VC_3具有最高的GPD预测数量,仅次于VC_1(由p- crasphage基因组组成),通过搜索序列确定了其他205个病毒群GPD与VC_3大末端酶基因有显著的相似性,把这种噬菌体称为肠道细菌性的噬菌体(Gubaphage),并研究了Gubaphage是否属于最近提出的crAss类家族,其中包括10个属和4个亚科。利用大末端酶基因构建了系统发育树来研究这一关系,由系统发育树得知,Gubaphage明显不同于其他crAss-like噬菌体,形成了一个独特的分支。

对其系统发育结构进行描述,结果表明,该进化支由两个簇组成,其中一个病毒亚科有2个属(G1和G2)。此外,在G1中还发现了由3个大簇组成的系统发育亚结构(G1.1、G1.2、G1.3)。宿主范围预测显示G1.1可以Bacteroides caccaeBacteroides xylanisolvens B、G1.3可侵染Bacteroides B vulgatus和G2 可侵染Parabacteroides merdaeParabacteroides distasonis。对其基因组的注释表明,Gubaphage被组织成3个不同的区域,其中一个为结构蛋白编码,第二个主要由参与DNA处理的基因组成,第三个为一系列假设的蛋白质编码(S5B)。对Gubaphage分支分布的分析结果表明,它在除南美洲以外的所有大陆上都存在,特别是,欧洲的流行率接近40%,而非洲最低(3%)

4研究结论

通过挖掘全球分布的 28,060 个人类肠道宏基因组和 2,898 个培养肠道细菌的参考基因组数据集获得。该数据库收集了 142,809 个非冗余噬菌体基因组,研究人员将高质量的肠道噬菌体基因组编译到肠道噬菌体数据库(GPD),分析了噬菌体的多样性和世界范围内的分布。

文献链接:

doi: 10.1016/j.cell.2021.01.029.

GPD数据库:

http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/metagenomics/genome_sets/gut_phage_database/